Francisco de Assis Magalhães Gomes Neto é engenheiro civil, formado pela Universidade de Brasília em 1985. Possui mestrado (1989) e doutorado (1995) em matemática aplicada pela Unicamp. Realizou pós-doutorado em Matemática Aplicada na Rice University, em Houston (1997) e tornou-se livre-docente em matemática aplicada pela Unicamp em 2001.

Professor do Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC) da Unicamp desde 1989, foi coordenador do curso de graduação em matemática aplicada (2000-2003), chefe do Departamento de Matemática Aplicada (2006-2009) e primeiro coordenador do Programa de Formação Interdisciplinar Superior (ProFIS) (2010-2012), tendo sido responsável pela implantação desse programa. Pela participação no ProFIS, recebeu, juntamente com outros professores da Unicamp, o prêmio Peter Murányi na área de Educação, em 2013. Entre 2014 e 2018, foi diretor do IMECC. Em 2018, assumiu o cargo de Diretor Financeiro da Fundação de Desenvolvimento da Unicamp (Funcamp).

Dentro da matemática aplicada, suas áreas de pesquisa são a otimização e a pesquisa operacional. Também se dedica às atividades de cunho didático, sendo autor do livro Pré-cálculo: operações, equações, funções e trigonometria, publicado em 2018 pela Editora Cengage. Em 2014, recebeu da Unicamp o prêmio de reconhecimento docente pela dedicação ao ensino de graduação.